.cpp/.mk/.oファイルがみんな同じディレクトリなのはアリなのか

業務チームのディレクトリはこうなってる。ディレクトリ名がsrcなんだけど。makeファイルがソースと同じディレクトリだとコンパイルしやすいけど、Windowsで編集したのをFFFTPでUNIXに突っ込むだけの人にはメリットあるように思えないんだけど。ファイル数３倍で見にくいし。